a biela do 1.6 é menor e o virabrequim maior:
Motor AE 1.0 – Curso 64,2mm
Motor AE 1.6 – Curso 83,5mm
Motor AE 1.0 – Bielas 138,2mm
Motor AE 1.6 – Bielas 127,8mm
Se você utilizar o Virabrequim do 1.6 terá que trocar as bielas e usar o cabeçote de 1.6 (o volume da camara é diferente), mesmo vale para usar só os pistões, cabeçote tem que ser trocado.
http://www.preparados.com.br/topic/45731-diferenca-bielas-motor-cht/